Roderic es un gran investigador, coincidí con él en un laboratorio de bioinformática hace algunos años.
Leo en DiarioMédico que comenta:
Roderic Guigó: "Secuenciar el genoma individual no es útil". Secuenciar el genoma humano parecía el inicio de una revolución, pero ocho años después sólo sirve para que una empresa comercialice un servicio de nula utilidad, según ha admitido el bioinformático Roderic Guigó.
Sobre la inutilidad de secuenciar el propio genoma ya hemos hablado varios médicos de familia.
Por supuesto cuando un periodista quiere saber si algo es útil no pregunta a los médicos del catarro sino a los expertos.
Decidí abandonar la investigación y hacer la especialidad de medicina de familia cuando asistí a la lectura de la tesis doctoral de un compañero que se había dedicado a comparar el genoma del pez globo con el de otras especies (incluida la humana).
Inicio su presentación asegurando que el conocimiento del genoma del pez globo era muy importante para la salud humana.
"Vale que lo que hacemos aquí es interesante... pero tanto como importante para la salud humana..." pensé yo.
Existe una brecha abismal entre la investigación básica y las necesidades reales de los pacientes. Incluso me atrevería a decir que existe una brecha abismal entre la investigación "superespecializada" y las necesidades reales de la mayoría de los pacientes.
Los biólogos (y la mayoría de los investigadores básicos) son unos tipos que no han visto a un paciente en su vida. Como nuestra sociedad no cree que el progreso científico sea un bien "en sí mismo" estos investigadores necesitan vender la moto a los políticos diciendo que su trabajo es importante "para curar enfermedades". Lo cual no es siempre cierto, y cuando lo es, se trata de aplicaciones indirectas y muchas veces inesperadas.
El problema es que al final los propios científicos llegan a creerse sus propios cuentos. Podemos leer:
Sobre este proyecto ha versado la conferencia que ha pronunciado [..] en la que se ha referido a la publicación del primer borrador de la secuencia del genoma humano en el 2001, que fue anunciado como un acontecimiento científico casi revolucionario por el ex presidente estadounidense Bill Clinton y el ex primer ministro británico Tony Blair.
Entonces se dijo que el conocimiento de las instrucciones genómicas tendría que proporcionar un control sobre los procesos biológicos y, en particular,una capacidad de luchar con eficacia contra las enfermedades sin precedentes en la historia de la humanidad. A pesar de eso, ocho años después, esa revolución no parece haber tenido lugar y el desciframiento de las instrucciones que en el genoma especifican las características biológicas de los seres vivos ha resultado ser más complejo de lo que se esperaba.
¡Por supuesto que no ha llegado esa anunciada revolución! la realidad es que todo aquel bombo sobre la secuenciación del genoma humano y su impacto en la salud humana no era más que propaganda, para justificar la inversión (lo triste es que haya que justificarlo de esa forma).
Los científicos básicos siguen, claro, en su torre de marfil donde uno puede perder rápidamente la perspectiva. Roderic insiste en la propaganda: la genómica vencerá a las enfermedades, solo necesitamos más tiempo... y más dinero:
Según Guigó, en la larga secuencia (tres mil millones) de únicamente las cuatro letras A, C, G y T está la clave de por qué una mariposa es una mariposa y por qué un humano es un humano. "Pequeños cambios en la secuencia de las letras pueden ser dramáticos (...). Estamos convencidos de que en la secuencia del genoma se explican todas las diferencias", ha apuntado, lo cual ya se ha visto en el caso de la enfermedad de Huntington. [...] "Nuestro problema es que cada día estamos al límite de la capacidad de nuestros ordenadores -la información genómica se multiplica cada año y la capacidad de los ordenadores, cada dos- y que necesitamos muchos científicos en este proyecto", ha manifestado.
Lo que no comprende (o quiere obviar) Roderic, es que en el genoma no está la clave de por qué un humano es un humano. Ni por ende, de por qué enfermamos o sufrimos.
Hace poco alguien lo expresaba en la revista Science (la misma donde se publicó y anunció a bombo y platillo la secuenciación del genoma humano) más o menos así:
El modelo dominante de enfermedad hoy en día es el biomédico, con la biología molecular como su disciplina científica básica. Este modelo asume que la enfermedad está definida por completo por alguna desviación de la normalidad de algunas variables biológicas (somáticas) medibles. Dentro de este esquema no hay espacio para las dimensiones psicológica o social del enfermar.
El modelo biomédico no solo requiere que la enfermedad tenga que ver con alguna entidad independiente del comportamiento social, también afirma que todas las alteraciones en el comportamiento pueden ser explicadas en base a alteraciones somáticas (bioquímicas o neuropsicológicas). De modo que el modelo biomédico adopta el reduccionismo (la postura filosófica de que los fenómenos complejos se derivan finalmente de un principio primario único), y la dualidad mente-cuerpo, la doctrina que separa lo mental de lo somático.
En este caso el modelo reduccionista es físico: es decir, asume que el lenguaje de la química y la física será finalmente suficiente para explicar los fenómenos biológicos.
Pero el modelo biomédico no es suficiente. Para conseguir las bases que nos permitan entender los determinantes de la enfermedad y plantear tratamientos y planes de cuidado racionales el modelo médico debe tener en cuenta al paciente, el contexto social en el que vive, y el sistema organizado por la sociedad para hacer frente a los estragos de la enfermedad, esto es, el rol del médico y el sistema de asistencia sanitaria.
Esto requiere un modelo biopsicosocial. Su ámbito está determinado por la función histórica del médico para establecer si una persona que pide ayuda está "enferma" o "sana"; y si está enferma, por qué y de qué forma lo está; y solo entonces elaborar un plan racional para tratar la "enfermedad" y restaurar y mantener la salud.
Las fronteras entre salud y enfermedad, entre estar "bien" o "mal" están muy lejos de ser claras y nunca lo estarán porque están difuminadas por consideraciones psicológicas, sociales y culturales. El punto de vista tradicional biomédico, es decir, que los marcadores biológicos son el criterio definitivo que define la enfermedad nos llevan a la actual paradoja de que a algunas personas con alteraciones en análisis de laboratorio se les dice que están enfermas y necesitan tratamiento, cuando en realidad se encuentran bien, mientras que a otras que se encuentran mal se les asegura que están bien, es decir que no tienen "ninguna enfermedad".
Quizá Roderic y los cientos de científicos empeñados en hacernos creer que el alivio a nuestro sufrimiento está encerrado en una secuencia de letras aún no han leido este artículo de Science. Lo cual no deja de ser paradójico, porque se escribió hace más de 30 años (y todavía seguimos persiguiendo a los mismos fantasmas).
Yo por mi parte, puestos a elegir secuencias de letras, me quedo con otras.
martes, 28 de julio de 2009
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La madre del Cordero, Bonis. Tengo que leerme esto una vez más.
ResponderEliminar(Gracias por el video, le estoy sacado partido ^^)
En Física, tenemos nuestro particular "proyecto genoma humano" y es la "teoría del todo". Pero su investigación no es tan inútil como pueda parecer.
ResponderEliminarVeras, el rimbombante nombre de "teoría del todo" se le da a la futura teoría que sea capaz de explicar las interacciones fundamentales de la naturaleza. Esas interacciones son 4: gravitatoria (que es la que sienten los objetos por tener una propiedad llamada "masa), electromagnética (que es la que sienen los objetos por tener una popiedad llamada "carga"), nuclear fuerte (que es la que sienten los objetos por tener una propiedad llamada "color" o "carga de color" (aunque no tenga nada que ver con el color, sólo es un nombre)) y la nuclear débil (que es la que sienten los objetos poar tener una propiedad llamada "sabor" (vale, aquí se demuestra que los Físicos tienen un gran sentido del humor).
Al igual que en su día se descubrió que la electricidad y el magnetismo eran casos particulares del electromagnetismo, estas 4 interacciones fundamentales son en realidad casos particulares de una única interacción fundamental.
Por ahora sólo se ha logrado unificar con éxito la teoría nuclear débil con el electromagnetico (dando lugar a la llamada interacción "electrodébil").
Casi se tiene unificada la nuclear fuerte con la electrodébil donde esa nueva interacción se llama "electronuclear".
Y la que se resiste es la gravitatoria. Esa no hay forma de unirla a nada.
Para ver si las teorías que se manejan son ciertas, se construyó el alecerador CERN y el más moderno LHC (el que se supone que creará un agujero negro que nos tragará a todos).
Lo de "teoría del todo" viene porque si se conoce esa teoría, ella podrá explicar cómo los quarks interaccionan entre sí y con el resto de partículas. Y cómo las agrupaciones de quarks (protones y neutrones) interaccionan entre sí. Y cómo los electrones interaccionan con los protones y neutrones para formar átomos. Y cómo los átomos interaccionan entre sí para dar moléculas, ... "And so on" como dirían los ingleses.
Como ves es una quimera. El modelo Físico de un átomo que no sea de Hidrógeno (es decir con un único electrón) es un problema gordísimo del que no se conoce solución exacta (las ecuaciones integro-diferenciales que te sacan 2 electrones moviéndose alrededor de un núcleo sólo se pueden resolver por métodos numéricos). Así que ni te digo ya el intentar explicar una molécula por la interacción entre quarks...
Pero la búsqueda es algo que nos está dando cosas más importantes. Con el CERN no sólo se construyó un acelerador de partículas donde se sacaron conclusiones muy interesantes... Para poder organizar la documentación, se inventó el WWW (con sus hyperenlaces). Para poder enfriar los imanes superconductores se avanzó en técnicas de crionización que luego fueron aplicadas (junto con esos imanes) en la construcción de aparatos de resonancia mucho más precisos.
En realidad el CERN es un gran experimento, pero también es una gran obra de ingeniería donde se innova en otros campos. Es como la investigación espacial, donde lo de menos es realmente el traer piedras de la Luna. Hasta llegar ahí se han desarrollado técnicas de comunicación vía satélite, microprocesadores, GPS... que merecen realmente la pena el haber hecho el esfuerzo invertido.
Mi desonocimiento sobre el proyecto del Genoma Humano es total, pero a raíz de la gran dotación de fondos, hay algunas otras cosas en el avance de la genómica que sí se han conseguido, como por ejemplo los chips genéticos (aunque bueno, sergún parecen no están cumpliendo lo que prometían).
No se, quizás lo de menos es la meta, quizás lo verdaderamente interesante es recorrer el camino.
PD. Y te he puesto uno (dos) links de agradecimiento.
ResponderEliminar¡Qué invasión!
Un saludo.
> No se, quizás lo de menos es la meta, quizás lo verdaderamente interesante es recorrer el camino.
ResponderEliminarExacto. El proyecto genoma humano es interesante en sí mismo. Debería invertirse en investigación básica para avanzar en el conocimiento. No hay que inventarse "aplicaciones", que luego vendrán (o no).
Como bien ilustras la investigación en el CERN dio lugar a la WWW, pero no me imagino a alguien del CERN en sus inicios diciendo: "necesitamos fondos para investigar la estructura del átomo, porque así conseguiremos que los adolescentes se intercambien fotos en el Facebook". (aunque eso es lo que ocurrió indirectamente).
En problema es que los biólogos utilizan el discurso de "vamos a curar enfermedades" para conseguir fondos. Ese discurso es falso (por simplificado)... pero llega a la opinión pública y luego hay empresas que lo utilizan.
Lo que me pregunto es si esos biólogos se han llegado a creer realmente su propia historia de que dentro del genoma está la cura a todas las enfermedades...
No creo que ni ellos mismos se lo crean. Símplemente es una forma de conseguir fondos y que los políticos suelten la pasta.
ResponderEliminarLamentablemente el bolsillo de los políticos sólo se conmueve ante cosas que den grandes titulares de prensa. Un "se consigue disminudir un 15% las listas de espera" es mucho menos efectivo como titular que "descrifrando el genoma humano conseguirmos la inmortalidad".
Cuentan que cuando se pidió pasta para construir el CERN, se le pidió a la pasta a la entonces ministra Margaret Thacher. Se le explicó lo importante que podría ser demostrar la existancia del bosón de Higgs. Ella dijo que muy bien, pero que se lo explicasen con un ejemplo que ella entendiese y así vería si soltaba la pasta o no.
La explicación que le dieron era que se imaginase un concurrido cóctel que se celebraba en un salón de un hotel. Si en ese cócktel entra una persona desconocida, podrá atravesar el cocktel con relativa facilidad. Si entra una persona importante (como por ejemplo ella), se le estarán constantemente acercando a saludarla, con lo que tardará mucho en conseguir atravesar la sala.
Los integrantes del cocktel son los bosones de Higgs, los cuales se suponen que están presentes en todas partes. Las personas poco importantes son las partículas que no interaccionan con los bosones de Higgs. Al atravesar la sala con relativa facilidad hace que esas partículas no tengan masa.
Cuando entra una persona importante, los bosones de Higgs se acercan a saludar a esa persona, interaccionando con ella, con lo que esa persona le cuesta mucho trabajo moverse por la habitación. Eso es lo que se supone que es la masa de las partículas: la interacción con el bosón de Higgs.
Al final soltaron la pasta, pero lo peor fueron los norteamericanos. Lo primero que hicieron fue preguntar ¿ese CERN tendrá alguna aplicación militar o civil?.
No, no nos creemos que vayamos a curar enfermedades descubriendo, por ejemplo, que proteína diana esta por debajo de tal ruta. Pero sí, es la única manera de que nos den pasta, tu vas a cualquier tribunal o pides cualquier proyecto.. y si pones, investigo tal ruta simplemente porque es desconocida, es investigación básica, y me va a ayudar a comprender el siguiente punto; te comes los mocos!
ResponderEliminarEl genoma humano, nos dio herramientas y un monton de trabajo interesante con el que trabajar; no sé por qué es tan dificil de entender.
Por cierto, me encanta este blog, la de cosas que se encuentran en google... voy a seguir leyendo..