¿Imaginan lo que podríamos hacer si tuviesemos acceso a las historias clínicas (debidamente anonimizadas) de más de 3 millones de pacientes y más de 10 millones de pacientes/año atendidos en consultas de atención primaria de toda España?.
Esa es la idea detrás del proyecto BIFAP, de la Agencia Española del Medicamento, donde he sido fichado recientemente (como los futbolistas pero sin cláusula millonaria de rescisión, aunque eso sí, mucho mejor que los contratos de suplencias que se ofrecen por ahí).
Con esa ingente cantidad de información (unos 2 Terabytes y creciendo) se pueden hacer muchas cosas.
Por ejemplo hace unos días una pediatra colaboradora del proyecto (son 1500 médicos de familia y pediatras facilitando datos) nos pidió información sobre los fármacos más recetados en población pediátrica en España. ¡Voilá! exportamos los datos a Google Public Data y ya podemos empezar a jugar. Veamos la evolución en la última década de dos moléculas apasionantes:
Pero la cosa no queda aquí. Pueden explorar los datos de todas las recetas emitidas (son más de 1300 principios activos y más de 2 millones de recetas) en nuestro registro en los últimos 10 años, o para mayor comodidad de los 112 principios activos más recetados.
Por supuesto en BIFAP disponemos de todo tipo de datos para ser explotados, desde número y duración de las visitas a diagnósticos, resultados de pruebas complementarias y todo lo que quepa en la historia clínica y pueda ser útil en investigación farmacoepidemiológica.
Así que mi tarea en los próximos años (mientras no aparezca Rajoy por aquí con las tijeras) va a ser la aplicación de algoritmos de minería de texto y lingüistica computacional (en los que ya trabajé hace años en mi tesis doctoral) y el apoyo a la realización de estudios en el ámbito de la atención primaria (que falta hace).
Si les ha interesado el asunto, pasan consulta estable como médico de familia o pediatra en atención primaria pueden ser colaboradores enviando los datos de sus cupos. A cambio recibiran informes anuales personalizados sobre su cupo (con comparación respecto a la población total de BIFAP) y podrán proponer estudios de investigación utilizando los datos de BIFAP. Solo tienen que rellenar un sencillo formulario.
domingo, 18 de marzo de 2012
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¡Qué interesante tu trabajo y este trabajo! He estado jugando con la gráfica y ya he empezado a especular (me) ciertas "teorías" acerca de lo que pueden reflejar esos datos... Echo de menos que no participe en el proyecto mi comunidad autónoma, País Vasco.
ResponderEliminarAnónimo,
ResponderEliminarOjo con las teorías, hay que entender muy bien como están generados y registrados los datos para poder sacar cualquier conclusión válida.
Es extraño que el Pais Vasco no participe dada su política de "gobierno abierto" y tal... depende mucho del tipo de Historia Clínica Electrónica que utilicen aunque hay comunidades con sistema no OMI-AP que ya han firmado convenios de colaboración.
Datos muy interesantes y sobretodo sorprende el metilfenidato.
ResponderEliminarUn proyecto que sospecho va a producir espectaculares datos. Me interesa participar, pero el enlace de registro no es operativo.
El enlace al formulario está roto.
ResponderEliminarVicenç
Soy una participante del proyecto desde que comenzo y como cada 6 meses te envian resultados de tus propios pacientes, resulta muy util y te das cuenta de donde estas fallando a la hora de registrar.
ResponderEliminarMe alegra ver que se trabaja en ese tema. Hace 10 años que comenzamos a trabajar en una experincia similar cuando ideamos un software análitico en forma de HCE con la que estamos trabajando en monopuesto varios compañeros desde el 2002. Con ello hemos conseguido adentrarnos en la microgestión sanitaria monitorizando tanto consumo de farmacos, pruebas diagnosticas, derivacione, bajas laborales, calidad de prescripcion, coste por patologias...
ResponderEliminarMe gustaria conocer tu experiencia porque me parece muy interesante.
Un saludo
Corregido el enlace que estaba mal copiado.
ResponderEliminarMe alegro por tu fichaje; en el Update 2012 en Barcelona, Vicente Ortún te mencionó como ejemplo.
ResponderEliminarAl tema, hace 5-6 años que colaboro con BIFAP a través de mi centro de primaria de Reus y es genial recibir información personalizada sobre tu cupo. Lo que desconocía, y es lo que me parece más interesante, es que pudiéramos proponer estudios de investigación usando esos datos o hacer consultas directas.
Supongo que recibís datos de cada uno de los diferentes programas informáticos de cada proveedor de servicios sanitarios; en Cataluña, he trabajado con SIAP-WIN, eCAP y ahora OMI-AP. Dado que son sistemas pensados más en el registro de datos para los gestores y menos en los clínicos, son poco eficientes, pienso yo, a la hora de hacer una explotación de datos más detallada si sólo nos basamos en el código diagnóstico o en el episodio. Se pierden muchos datos si no se hace revisión historia a historia porque cada médico pone un dato en un sitio o en otro. ¿Existe algún sistema de inteligencia artificial que pueda rescatar, a través de palabras clave, información que se perdería por "estar en el sitio/pestaña/carpeta/episodio equivocado?
De momento la informática en vez de ayudarnos nos entorpece más en el trato de la información debido a esos penosos programas.¿Hay alguno suficientemente bueno como para que se pudiera compartir a nivel nacional?
No acabo de entender el funcionamiento del proyecto.
ResponderEliminarLos datos de prescripción se tienen ya, no con lo prescrito en la HCE (los pacientes son inteligentes y no retiran a veces de las farmacias los medicamentos prescritos ), sino con lo facturado por las farmacias.
Desde siempre las farmacias elaboraban sus listados de medicamentos dispensados, con los datos de médico, laboratorio, precio. Con lo cual la farmacia cobraba y el Insalud tenía datos de prescripción que en general no usó en toda su amplitud.
Ahora con la HCE, en el ordenador queda recogido lo prescrito, pero lo dispensado y por tanto facturado se obtiene de los listados facilitados por las farmacias.
Y ahora, gracias a la receta impresa, no a un garabato, un sello que no se leía, etc, se puede obtener sin ningún problema la información de lo que han recetado los médicos y con ello obtener datos de principios activos, recetas efg o marcas, laboratorios, etc, etc.
Eso ya está y creo que los SNS no han hecho uso de esta información que puede servir para muchas cosas, incluidas las que plante el proyecto al que te has unido.
Otra cosa es la HCE. Yo conozco la HCE desde hace solo seis años y medio.
Lo que he visto en este tiempo, y habiendo conocido otras HCE distintas a la que tengo, es que uso de las mismas por los usuarios es de calidad muy dispar.
Hay quien usa la historia para automatizar recetas y partes (y lo primero es más real estudiarlo de la facturacion), y para escribir cosas, no introducir datos.
Con lo cual es imposible explotar ningun dato.
Si escribimos no fuma, pero no damos al check de fumador, resulta que las cosas se han hecho, pero no se pueden explotar.
Las HCE son como bien sabes, datos y texto. El segundo puede ser estupendo, pero no sirve para nada de lo que planteas, porque si ya era difícil mirar una historia escrita a mano, hacerlo en una electrónica es imposible.
Por lo tanto me parece que el proyecto es bueno (saber lo que uno hace, para poner medios de mejora y reevaluar y con ello mejorar la calidad del trabajo pero no acabo de verlo.
Ya me lo explicarás y ya te lo explicaré.
Salud..os.
> Las HCE son como bien sabes, datos y texto. El segundo puede ser estupendo, pero no sirve para nada de lo que planteas, porque si ya era difícil mirar una historia escrita a mano, hacerlo en una electrónica es imposible.
ResponderEliminarEstás equivocado. La información contenida en texto libre, que es el 80% de la información generada en el mundo, sí es explotable. Otra cosa es que haya que saber como hacerlo:
http://www.youtube.com/embed/kMn-HigfqZc
http://people.ischool.berkeley.edu/~hearst/text-mining.html